髙杜神社本殿は、軒破風付きの建物で上屋の中に建つ。建築年代は棟札から嘉永元年とわかる。大工棟梁は、三代の亀原和田四郎嘉博。
彫刻をみると、向拝木鼻が振向きの龍、向拝紅梁の中央に波・亀、軒唐破風内部に麒麟、兎の毛通しに鳳凰、脇障子は松・鶴、牡丹・唐獅子となっている。社殿の特徴は、正面の扉を両開きの扉としないで、4枚一連の両折り戸としていることや、向拝木鼻を振向きの龍としている点も独創的である。
本社は、入母屋造り、桟瓦葺きの建物で1間の向拝を付けている。妻入りなので本殿上屋部分とは棟を直行させて撞木造りとなっている。天明2年の再建とみられ、時代の特色をよく示している建造物といえる。いずれも建築物として衣装的に優秀であり、文化財としての価値が高い。
